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超算與疫情防治論壇探讨高性能藥物篩選

2020-09-29

9月(yuè)28日下(xià)午,全國高性能計算學術(shù)年會(HPC-CHINA2020)“超級算力與人工智能助力新冠疫情防治”論壇線上順利召開。論壇上半場圍繞高性能藥物篩選展開。上海交通(tōng)大學生命科學技術(shù)學院生物報訊信息與生物統計系魏冬青教授、中(zhōng)山大學藥學院副司土院長羅海彬教授、轉化醫學國家重大科技基礎中(zhōng)月湖心研究員呂綱教授分别做了彙報。國家超級計算深圳中(zhōng)心火木主任馮聖中(zhōng)和(hé)中(zhōng)科院深圳先進技術(sh數銀ù)研究院高性能計算研究中(zhōng)心執工美行主任魏彥傑主持了本次活動(dòng)。

魏冬青教授作了題為“大數據時代的個(gè)性化藥物設計去車及新冠藥物研發應用”的報告。魏教授團隊通(tōng)過超級計算機篩選出了新冠照外病毒的有效多肽抑制劑——人腸防禦5,該抑制劑通(tōng)過掩蔽受體,抑制新冠病毒突刺蛋白對人黏膜細胞的侵襲,從而阻斷新冠病光外毒傳染途徑,在臨床上對預防新冠感染表現出良好的效果。

羅海彬教授作了題為“HPC驅動(dòng)的肺部炎症性疾病候選藥物發電日現及臨床驗證”的報告。羅教授團隊自主研制出一套生物醫短木藥軟件系GA-FEP,驅動(dòng)新冠肺炎藥物篩選,最終篩選的25種藥物中(zhōng)有16種被臨床證明有效,成功率超過60%,遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于MM-PBSA等其他傳統方法。其中(zhōng),篩選出制秒的潘生丁藥物,被用于改善新冠肺炎重型患者的凝血功能,顯著提升了區紙患者的治愈率。

呂綱研究員作了題為“多組學研究背景下(xià)的答工高端計算——新冠疫情中(zhōng)的科冷視研實踐”的報告。面對新冠疫情,國家轉化醫學中(zhōng)心在45天内完成樣本測序、基因組裝、編譯分析、數據庫提交,相關(guān)成果發唱笑表于《Nature》上。

線上觀衆針對藥物篩選軟件的優劣,GA-FEP加速的核心原理、多組分數據融合等方面的問(wèn)題進行了提問(wèn)和森明(hé)探讨,演講嘉賓對這些問(wèn)題進行了耐心的解空間答。

應對新冠疫情,國家超算深圳中(zhōng)心第一時間、全球首著了倡,免費為國内外藥物篩選、疫情傳播模拟等各方面科技工作者提間物供算力支撐,産生了廣泛的社會影響。

今年的全國高性能計算學術(shù)年會在線上進行,演講嘉賓和(hé)聽衆熱情不關笑減、交流暢通(tōng),達到了組織者期待的預期效果。

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